A.期刊論文
魏淑惠、石振國，2016，＜政府推動認養代替購買寵物之政策行銷分析＞，《中華行政學報》，20：135-152。

石振國，2016，＜政策停頓的特徵、原因與影響：以證所稅復徵及大戶條款為例＞，《中華行政學報》，18：55-73。

陳悅婷、石振國，2015，＜新竹科學園區交通問題解決方案之規劃研究＞，《中華行政學報》，17：119-136。

王宏男、石振國，2015，＜軍人之友社的組織變遷-從依賴到自主＞。《中華行政學報》，16:：7-26。

石振國，2014，＜從方案評估理論反思《都市更新條例》＞。《中華行政學報》，15:：7-25。

蔡宜廷、石振國，2014，＜非營利組織推廣環境公益信託之案例分析＞。《中華行政學報》，14:：5-55。

殷錦娟、石振國，2013，《多元就業開發社會型方案之回應性評估》，中華行政學報，12：107-126。

畢兆偉、石振國，2012，《非營利組織社會行銷個案探討：以促進兒童用藥安全為例》。中華行政學報，10:137-172。

石振國，2011，〈從科技治理體系觀點省思新竹科學園區的治理困境〉，《政策研究學報》，第十一期，頁：207-236。(NSC97-2621-M-216-006)
石振國、高崇安，2011，〈我國海洋事務機關組織變遷之研究〉，《中華行政學報》，第八期，頁：157-176。
石振國，2010，〈影響政治vs.干涉政治：台灣遊說制度的解剖〉，《文官制度季刊》，第二卷，第二期，頁：55-75。
石振國、游威倫，2008，〈台北市流浪犬管理政策分析─公私協力互動模式觀點〉，《中華行政學報》，第五期，頁：243-260。
石振國，2008，〈說故事管理在公部門的應用〉，《中華行政學報》，第五期，頁：43-54。
石振國、謝維鈞、，2007，〈國民年金方案的比較研究──政策論證的分析途徑〉，《中華行政學報》，第四期，頁：81-101。
石振國，2007，〈美國府際合作機制的建構與經驗學習──ACIR與NRDP的比較分析〉，《中華行政學報》，第四期，頁：67-80。
石振國，2006，〈美國府際合作經驗對台灣制度學習的啟發：全國鄉村夥伴關係計畫的個案分析〉，《中華行政學報》，第三期，頁：173-184。
石振國、林水波，2005，〈政黨合併的意涵與鑑定─以國親兩黨為例〉，《政治學報》，第39期，頁：1-40。（TSSCI）
石振國，2002，《政黨趨同之研究─國民黨與民進黨的比較分析》，台北：國立台灣大學政治學研究所博士論文（未出版）。
石振國，2002，〈跨越學習型組織的七大陷阱〉，《人事月刊》，卷34，期六：26-30。
林水波、石振國，1999，〈立委選制的理論省思與改革方案的影響評估〉，收於林水波著《制度設計》，台北：智勝：47-66。
林水波、石振國，1999，〈以直接民主改革間接民主的論述與評估〉，《立法院院聞》，卷27，期三：33-44。

B.研討會論文
石振國，2015，《政策停頓:以大戶條款為例》，2015兩岸『公民參與與公共政策』學術研討會，台北市：2015年3月。

石振國，2013，《《都市更新條例》的再思考：方案評估理論的初步應用》，城市發展與復原治理研討會，高雄市：2015年12月。

石振國、王宏男，2012，《南沙諸島︰「擱置主權、共同開發資源」以網絡治理觀點為分析架構》，第二屆重慶市政治學年會暨社會轉型與學術發展研討會，重慶市：2012年12月。

石振國、王宏男，2012，《組織的自主性-以軍人之友社為例》，第七屆轉型與治理學術研討會，台北市：2012年3月。

石振國，2011，〈從視框反省觀點探討我國科學園區的治理盲點與因應方向〉，發表於中華大學行政管理學系舉辦，「第五屆地方政府與公共管理學術研討會」，新竹：2011年12月9日。
石振國，2010，〈影響政治vs.干涉政治：台灣遊說制度的解剖〉，發表於世新大學行政管理學系舉辦，「政治管理學術研討會」，台北：2010年1月29日。
石振國，2006，〈國民黨組織變遷與臺灣民主化歷程的辯證關係〉，發表於台灣智庫主辦，「公共服務與社會參與」研討會，台北：2006年2月14日。
石振國，2005，〈美國府際合作的制度設計與運作經驗〉，發表於行政院研考會舉辦，中區「推動府際合作公共論壇」研討會，台中：2005年11月11日。
石振國，2004，〈政黨合併的特性、模式與評估─以國親兩黨為主要案例〉，發表於台灣政治學會主辦，2004年台灣政治學年會暨「關鍵年代與多元政治」學術研討會，高雄縣：2004年12月18日。

C.專書論文
Shih Chen-Kuo, 2009 <Party Politics in Taiwan> in《The Political System in Taiwan》M.Porsche-Ludwig & Chin-Peng Chu eds., Munich: Nomos pp.71-91.

D.研究計畫
石振國，2008，《科學園區生態化制度建立與新世代環境政策研究－新竹科學園區之組織績效、變革方案與經驗擴散之評估:治理結構的觀點（計畫編號：NSC97-2621-M-216-006）》，計畫主持人。

E.專書

《政黨趨同之研究─國民黨與民進黨的比較分析》,國立台灣大學政治學研究所博士論文,2002/06